По окончании войны с пекотами в 1638 г. в Новой Англии установился шаткий мир, но отношения между индейцами и колонистами постепенно ухудшались. Многие колониальные лидеры, которые когда-то их налаживали, со временем умерли; умер и сахем вампаноагов Массасойт. Им на смену пришло новое поколение дипломатов, куда менее склонное к сотрудничеству. Изменились и отношения между самими индейцами - разные племена за счет договоров с белыми колонистами рассчитывали упрочить собственные позиции. Всё это, помноженное на упадок торговли пушниной и вампумом с одной стороны и земельный голод в разрастающихся английских колониях - с другой, в конце концов привело к вооружённому конфликту, вошедшему в историю под именем "Войны царя Филиппа".

После смерти Массасойта в 1661 г. новым сахемом вампаноагов стал его сын Вамсутта, принявший европейское имя Александр. Вамсутта продал часть племенных владений колонии Род-Айленд, однако на те же самые земли претендовала колония Плимут.

Власти Плимута арестовали Вамсутту и предъявили ему обвинения в подготовке заговора. Находясь под арестом, он заболел и, когда был оправдан и отпущен, скончался по возвращении домой. Многие из соплеменников Вамсутты, в том числе его брат Метаком (или Метакомет, известный англичанам под именем Филиппа), считали, что колонисты отравили его. Поэтому, став новым сахемом, Метаком уже с самого начала им не доверял.

Ситуация накалилась еще больше, когда в 1667 г. плимутцы основали новый город Суонси на Фолл-Ривер. Мало того, что они выбрали место буквально под боком у Метакома, - эта земля вообще не принадлежала колонии. Сахем пытался протестовать и даже угрожать, но его в конце концов убедили смириться. Поселенцы рассмотрели протест на совете Соединённых Колоний, но не только не удовлетворили его, а напротив, наложили на вампаноагов такой штраф, что Метаком просто был вынужден продать спорную территорию. Однако вырученных денег ему хватило не только на уплату штрафа, но и на покупку новой партии мушкетов.

Есть основания полагать, что Метаком планировал большую войну с колонистами и собирался для этого объединить соседние племена. Как бы то ни было, англичане направили к нему осведомителя в лице Джона Сассамона, индейца-христианина, закончившего школу в Гарварде и ранее уже работавшего у Метакома переводчиком. Сассамон доложил, что вампаноаги готовятся к войне. Вскоре после этого он был найден мертвым. По подозрению в убийстве колонисты арестовали, судили и казнили трех индейцев; это и стало поводом к началу военных действий. После казни город Суонси был оставлен, а затем разграблен разъярёнными вампаноагами.

События в Суонси застали врасплох обе стороны конфликта. Колонисты не могли решить, обороняться ли им или самим перейти в наступление. Колония Массачусетс, которая сама претендовала на земли соседнего племени наррагансетов, последовала примеру Плимута и объявила мобилизацию. Хотя массачусетцы и плимутцы не всегда ладили, очевидно, в этом случае они оставили прошлые разногласия и договорились разделить сферы влияния после войны. Собственно, "Соединённые колонии" и были прежде всего военным союзом, созданным именно для борьбы с общим врагом.

Со своей стороны, Метакому не удалось договориться о союзе с наррагансетами. Кое-кто из них согласился, но племя в целом отказалось участвовать в войне. Оказавшись перед необходимостью сражаться, когда он не был к этому готов, он, тем не менее, не отступил и провёл серию набегов на близлежащие поселения колонистов. После этого Метаком перебрался на территорию покассетов, которой управляла женщина-вождь Уитамо [Weetamo] - его невестка, вдова Вамсутты. Организовав лагерь в болотах Покассет, он успешно избежал всех попыток захватить его, а затем ушёл на северо-запад. Колонисты и их союзники-мохегане преследовали Метакома, но поймать не смогли.

Однако в целом англичане продолжали следовать оборонительной стратегии, хотя некоторые (в частности, 35-летний капитан Бенджамин Чёрч из Род-Айленда) призывали к более решительным действиям. Чёрч считал, что подразделениям колониальной милиции следует заимствовать индейский опыт войны в лесу; в конце концов он получил разрешение реализовать свои идеи на практике и добился здесь заметных успехов. После войны Чёрч с сыном опубликовали книгу об истории войны, основанную на его полевых заметках.

Не в силах разгромить Метакома, Соединённые Колонии зимой 1675-76 гг. решили провести военную кампанию против наррагансетов. Армией почти в тысячу человек командовал плимутский губернатор Джозия Уинслоу; как и Метаком, он был сыном прежнего лидера (в его случае - первого губернатора). Наррагансеты тем временем построили сильную крепость в болотистой местности. Путь к ней колонистам указал пленный индеец. Они дважды ходили на приступ, бой был упорным и обе стороны понесли большие потери. Англичане выбили оттуда защитников только после того, как подожгли крепость. Но успех оказался сугубо тактическим - наррагансеты, ранее заявившие о нейтралитете, теперь открыто поддержали Метакома.

Это племя во главе со своим вождём Канончетом, сыном Миантономо [Canonchet, son of Miantonomo] само по себе было грозным противником. Некоторые исследователи считают настоящим лидером индейцев именно Канончета, а не Метакома. В начале весны 1676 г. наррагансеты сожгли города Реобот и Провиденс в Род-Айледе.

В феврале 1676 г. Метаком атаковал и сжёг город Ланкастер в Массачусетсе. Многие жители были убиты, часть попала в плен. В числе последних оказалась Мэри Роулендсон [Mary Rowlandson] - возможно, самая известная пленница индейцев в колониальной истории. После своего освобождения она написала книгу о своих приключениях, которая затем стала бестселлером. Весной-летом боевые действия вышли за пределы южной Новой Англии; в мае 1676 г. группа абенаков-сококи пришла с севера в деревню Пескеомпскут [Peskeompskut] на р. Коннектикут (у современного Тёрнерс-Фоллз, шт. Массачусетс).

Раздосадованный тем, что колонии не могут прекратить нападения индейцев, капитан Уильям Дж. Тёрнер вслед за Чёрчем призвал перенести войну на территорию врага. От пленного он узнал, что деревня почти не охраняется. Тёрнер внезапно атаковал её, когда большая часть воинов отсутствовала, и вырезал несколько сот человек. Однако воины вернулись, и теперь уже Тёрнер оказался в отчаянном положении. Английский отряд не был уничтожен, но понёс тяжёлые потери; погиб и сам Тёрнер. Тем не менее, колонисты успели уничтожить в деревне оружейные мастерские, где индейцы чинили мушкеты, а также большое количество свинца и других припасов. Быстро возместить ущерб индейцы не могли.

Летом 1676 г. англичане организовали несколько небольших частных экспедиций против Метакома, но особых успехов не добились. Им повезло только в середине августа, когда они смогли отыскать и уничтожить лагерь Метакома на болоте Ассовамсет [Assowamset Swamp] у Маунт-Хоуп (ныне Бристоль, шт. Массачусетс). Погиб и сам сахем - по иронии судьбы его застрелил индеец на английской службе. Метакому отрезали голову и выставили на шесте в Плимуте. Однако гибель вождя не означала конец войны - летом 1677 г. она перекинулась в Нью-Гэмпшир и Мэн. Только после заключения мирного договора в Каско (1678 г.) боевые действия прекратились.

"Война царя Филиппа" стала самой кровопролитной в истории Новой Англии. В ней погибло около трёх тысяч индейцев, из которых примерно треть пришлась на вампаноагов. Жена и девятилетний сын Метакома были проданы в рабство в Вест-Индию. Тяжёлые потери понесли и колонисты - по приблизительным подсчётам, около 1300 солдат и 1000 гражданских лиц. В ходе войны подверглись нападению около 90 английских городов, многие из которых были сильно разрушены, а 12 уничтожены полностью. Для дальнейшей истории региона война имела самые серьёзные последствия - способность местных индейцев к сопротивлению была раз и навсегда подорвана, изменилось и управление самими колониями.